Esto equivale a aproximadamente dos tercios de todos los nativos en Columbia Británica.
Algunos nativos creían que la epidemia se estaba propagando deliberadamente con el propósito de robar sus tierras.
Algunos documentos recomendaron permitir que la viruela se propagara entre los nativos mediante la retención deliberada de vacunas y ayuda.
[2] Había varios grandes campamentos nativos semipermanentes alrededor de Victoria en ese momento.
El 18 de marzo, The Daily British Colonist informó que un pasajero tenía la enfermedad.
California estaba luchando con la viruela en ese momento, pero las vacunas y otras medidas preventivas habían mantenido el número de muertos relativamente bajo.
[1] El gobernador James Douglas contrató al médico de Hudson's Bay Company, el Dr. John Helmcken, para vacunar a los Songhees.
Pemberton, con el permiso del gobernador Douglas, ordenó a los Tsimshians que se fueran dentro de un día, tenía un cañonero estacionado para hacer cumplir la orden, y colocó guardias armados alrededor de Victoria para evitar que los nativos entraran.
Sin embargo, durante el mes de mayo la epidemia continuó devastando a los nativos que aún vivían en el campamento del norte.
[3] Cuando el campamento de la Bahía de Cadboro estaba vacío, la policía fue a lo que quedaba del Campamento Del Norte y quemó todas las viviendas, dejando unas 200 Haidas sin canoas.
El misionero oblato católico Leon Fouquet y su compañero el Padre Pandosy vacunaron a un gran número de pueblos halkomelem como el Cowichan Quwutsun, así como a algunos miembros de otros grupos como el okupa y el shishalh.
Fourquet también envió un gran suministro de vacunas a Casimir Chirouse en Tulalip.
Algunos nativos intentaron inocularse a sí mismos, aunque no se sabe cuántos y cuán efectivo fue.
A medida que la enfermedad se propagaba, los pueblos indígenas sufrieron pérdidas devastadoras.
Haida Gwaii experimentó una gran cantidad de abandono y consolidación del pueblo.
Muchas aldeas históricas de Haida fueron abandonadas en los años posteriores a la epidemia, incluyendo Ninstints, Kloo, Skedans, Cumshewa, Dadens, Haina, Hiellen, Kung, Klinkwan y "Old" Kasaan, entre otros.
Sobrevivientes consolidados en cuatro asentamientos principales: Skidegate, Masset, Hydaburg y "New" Kasaan.
[3] Tlingits conducidos desde Victoria llevaron la viruela a la zona del río Stikine.
Algunos de los refugiados fueron escoltados por el cañonero HMS Topaz desde Victoria hasta Alaska.
No hay registros que sobrevivan a la situación en la zona de Stikine durante julio y agosto, cuando la epidemia probablemente estaba en su apogeo.
Algunos grupos Tlingit no habían formado parte del programa ruso y éstos fueron diezmados por la enfermedad, especialmente la Henya Tlingit de la isla norteña príncipe de Gales.
En 2014, la primera ministra de Columbia Británica Christy Clark exoneró formalmente a los jefes ejecutados y se disculpó por estos actos, reconociendo que "hay una indicación [de que la viruela] se extendió intencionalmente".