Los mamíferos poseen cuatro grupos de genes similares homeobox, HOXA, HOXB, HOXC y HOXD, ubicados en diferentes cromosomas, que consta de 9 a 11 genes dispuestos en tándem.
Las deleciones que eliminan todo el grupo de genes HoxD o el extremo 5 'de este grupo se han asociado con algunas anomalías genitales.
Las mutaciones en este gen causan particularmente sinpolidactilia y braquidactilia.
[2] El producto del gen de ratón Hoxd13 juega un papel en el desarrollo esqueleto axial y la morfogénesis anterior.
José Luis Gómez-Skarmeta, del Consejo Superior de Investigaciones Científicas de España, descubrió que si se aumentan los niveles del gen hoxd13 en aletas de peces cebra, se incrementa la aparición de tejido óseo de carácter distal similar al que generan los dedos en animales bipedos.