El estado en otomí se dice Maxei; y en náhuatl, Chichimecalco (Lugar de los chichimecas).
Otra versión dice que el nombre proviene del Otomí con significado "Lugar donde se juega la pelota", o "Lugar del gran juego de pelota".
El territorio que hoy ocupa el Estado de Querétaro fue habitado por Otomíes y Purépechas (Tarascos), siendo estos últimos los dominantes.
Había también una pequeña presencia de tribus nómadas llamadas Chichimecas (pames y jonaces).
Cuenta la leyenda que en el arreglo se establecía que los Otomíes aceptarían el gobierno español y aceptarían la fe Católica si éstos eran derrotados en una batalla cuerpo a cuerpo (sin armas).
Los conquistadores españoles estaban por perder cuando, de repente, el Sol fue eclipsado al momento en que apareció el apóstol Santiago y una brillante cruz.
Expediciones armadas y conversiones católicas fueron enviadas desde la ciudad de Querétaro.
Entre 1726 y 1738 fue construida la mayor obra de ingeniería civil en el estado: El Acueducto.
En 1735 se inaugura la caja de agua, que fue la primera fuente de la ciudad y en 1738 llega el agua a las distintas pilas públicas diseminadas por toda la ciudad.
Trabajó en la obra Ortiz de Castro y en la decoración Tresguerras.
El día 13 es tomado prisionero Epigmenio González, teniendo un arsenal de armas destinado a la Insurgencia.
En 1987 es sede del concurso de belleza Señorita México, celebrado en el auditorio Josefa Ortiz de Domínguez, en donde la ganadora resultó ser la poblana Amanda Beatriz Olivares Phillips, quien un año más tarde ocuparía el segundo lugar en el certamen Miss Universo 1988 celebrado en Taipéi China.