A los cinco años tuvo su primer contacto con el instrumento; su padre lo inscribió en la Academia Oliva, de Lanús.
Cuando Juanjo tenía quince años dejó sus estudios clásicos y se decantó por la guitarra popular.
Además tocaba con un trío melódico llamado Los Antonios, el cual interpretaba valses peruanos y boleros, acompañando al cantante Bienvenido Cárdenas.
[3] Domínguez grabó más de ciento treinta discos a lo largo de su carrera, con compañeros como Rubén Juárez, Hugo Marcel, Alberto Morán, Alberto Echagüe, María Graña, Alberto Podestá, Horacio Molina, Chango Nieto, María Martha Serra Lima, Andrés Calamaro,Virginia Luque en dúo con Raúl Barboza y muchos más, aunque dos de sus máximos lazos estéticos hayan sido con Roberto Goyeneche y Horacio Guarany.
Grabó 24 discos como solista yendo desde el jazz hasta la música argentina (tangos, milongas, zambas y valses criollos).