Esta especie fue descrita originalmente en el año 2009 por los ictiólogos Ricardo Cardoso Benine, Tatiane Casagrande Mariguela y Claudio de Oliveira.
[1] Al comparar muestras de Moenkhausia forestii con otras especies relacionadas mediante un análisis molecular, usando secuencias parciales del gen mitocondrial Citocromo Oxidase I, sus descriptores demostraron que es fácilmente identificable por su elevada distancia genética respecto al resto.
[1] Moenkhausia forestii pertenece al “grupo de especies Moenkhausia oligolepis”,[1] el cual está integrado, además de M. oligolepis, por M. cotinho C. H. Eigenmann, 1908, M. pyrophthalma W. J. E. M. Costa, 1994 y M. sanctaefilomenae (Steindachner, 1907).
Estas especies comparten un patrón de color muy similar consistente en un diseño reticulado formado por bordes oscuros en las escamas, una mancha humeral alargada verticalmente, una mancha oscura conspicua en el pedúnculo caudal la cual está precedida por un área más clara y, frecuentemente, el ojo de color rojo vivo.
[1] También fue registrada en el río Paraná Superior, sin embargo, los autores adjudican su presencia allí a una expansión artificial de su distribución al haber logrado remontar el sistema de transferencia para peces denominado canal de Piracema, el cual fue construido junto a la represa hidroeléctrica de Itaipú, permitiéndole así superar la barrera física natural que representaban los saltos del Guairá.