A lo largo de su carrera como ciclista profesional, Godefroot fue descalificado hasta en tres ocasiones por dopaje.
Tras retirarse como ciclista profesional, Godefroot se convirtió en director deportivo, dirigiendo a los equipos IJsboerke, Capri Sonne, Lotto y Weinmann.
En 1992 fichó por el equipo Telekom, donde dirigió, entre otros, a ciclistas como Bjarne Riis, Jan Ullrich, Andreas Klöden o Erik Zabel.
Al término de la temporada 2005, Godefroot se desvinculó del conjunto alemán y se mantuvo alejado del mundo del ciclismo hasta que, en julio de 2006, entró en nómina del equipo Astana como consejero, a petición de Alexandre Vinokourov.
1964 1965 1966 1967 1968 1969 1970 1971 1972 1973 1974 1975 1976 1978 1979 Durante su carrera deportiva ha conseguido los siguientes puestos en Grandes Vueltas y carreras de un día: —: No participa Ab.