Tiene una antigüedad aproximada de 60 000 a 65 000 años y probablemente se originó en la India.
Cuenta entre sus descendientes a los haplogrupos C, Z, D, E, G, Q y numerosos subgrupos de M. El origen del haplogrupo M, al igual que N, está relacionado con la expansión del Homo sapiens fuera de África.
Es probable que primero pobladoras L3 dejaran el África Nor-oriental (Etiopía) atravesando el Cercano Oriente y que al llegar a la India hace 60 000 años dieran origen al haplogrupo M. El origen indostánico se ve reforzado por la gran cantidad de haplogrupos antiguos derivados de M presentes al Sur de Asia;[1] además es en India y Bangladés donde se encuentra la mayor concentración del macrohaplogrupo M* con frecuencias que van del 60 al 80 % de la población.
[2] La población precursora de este grupo, habitó durante la Edad de Hielo llamada Würm/Wisconsin, última que conoció la tierra terminando el Pleistoceno, llamada también la “glaciación antropológica” que comenzó hace 100 000 años y terminó hace 10 000.
Esta región iba en un continuo desde el valle del Indo hasta Sondalandia (Sureste asiático), y resultaron muy favorables para el crecimiento demográfico, de tal manera que probablemente no exista en el Paleolítico un caso similar de rápida diversificación genética; tal como lo demuestran los numerosos descendientes de M representados por al menos 44 clados descubiertos que ya están bien definidos.